黑枕藍鶲的雄鳥從頭、胸至背部皆為藍色，頭上有一黑色斑，前頸有一黑色環帶，背部略帶灰色，腹部以下為灰白色。而雌鳥的藍色較淺，體背褐色，頭頂及頸並無頸環。

黑枕藍鶲屬於留鳥，多半單獨活動，停棲時大多身體挺直，時常棲息於樹林灌木叢、草叢地帶或其附近之林緣地帶。個性活潑，非繁殖季會和繡眼畫眉、粉紅櫻嘴或山紅頭混群覓食。黑枕藍鶲的主要食物為昆蟲。海拔 0 至 1,500 公尺可見其蹤。